灰指甲根治简单有效的方法是，口服抗真菌药和外用药联合治疗。
灰指甲又称甲真菌病，主要是由真菌感染甲板和甲床引起的。如果灰指甲病变较表浅或者没有侵犯到甲根时，一般外用抗真菌药物，比如阿莫罗芬擦剂，就可以根治灰指甲。如果灰指甲已经侵犯到甲根或者整个指甲都出现了病变，此时症状比较严重，单用外用药物往往杀死真菌的作用比较差。因此，灰指甲的治疗还需要口服抗真菌药物。
目前，常用的口服抗真菌药物主要是伊曲康唑和特比萘芬；外用抗真菌药，比如阿莫罗芬搽剂、特比萘芬软膏、舍他康唑软膏等进行局部涂擦。通过口服和外用药物联合使用，通常能够根治灰指甲。
灰指甲诊断明确后，患者一定要在医生的指导下，遵医嘱服用药物治疗。但是，如果灰指甲是由脚气导致的，还要积极治疗脚气。