胰腺囊肿挂科时，可以选择肝胆外科或者消化内科，两个科室对于胰腺囊肿都能进行治疗。有些医院对于胰腺囊肿治疗，可能还会划分到普外科。其实，治疗胰腺囊肿时，挂哪个科室并不影响它的治疗。一般只要去正规的医院，接受专业医师进行看诊就可以了。另外，有时胰腺囊肿考虑到是多个因素引起，所以在接受治疗的过程中，可能医生还会让同时挂另外一个科室。因此，对于胰腺囊肿挂什么科，肝胆外科、消化内科、普外科，患者可以根据实际情况进行选择。