肾盂癌常见的病理类型是尿路上皮细胞癌，这类癌对放、化疗敏感性尚可。因此高度恶性的肾盂癌根治术后或者无法手术根治的病人，术后化疗是常规的治疗方案。
如今，随着化疗药物和放疗技术的进步，对于某些有局部外侵，尤其是输尿管和肾盂肿瘤侵犯到浆膜以外，或有局部淋巴结转移的病人，在根治手术后，可以辅助化疗，部分患者可以选择免疫治疗或者靶向治疗。
对于早期或低度恶性肾盂癌，全身化疗不作为常规治疗方法，而膀胱灌注化疗需要做的，膀胱化疗药物局部灌注，诱导期每周1次。晚期肾盂肿瘤恶性程度及浸润程度均较高，术后1-2个月行全身化疗，可减少局部淋巴及潜在全身肿瘤转移的可能性。具体化疗方案谨遵医嘱执行。