肾部分切除术适应证分为绝对、相对和选择性三种类型。
绝对适应证是指解剖性或功能性的孤立肾患者，切除肿瘤的同时保留正常肾组织避免出现尿毒症，但也不绝对限于肿瘤，如先天重复肾也需部分切除术；相对适应证是指虽然对侧肾脏有功能，但存在某些潜在疾病，可能导致肾功能受损，如对侧肾有肾结石、良性肿瘤等；选择性适应证是指对侧肾脏健康，如果肿瘤直径未超过4cm，则选择行肾部分切除术，最大限度地保留肾脏功能。
此外，肾结核两侧轻度毁损，远期药物治疗无效的，如必须进行部分肾切除术的，则应保留健康的肾组织，以避免术后肾功能不全。